Keroro vs. Keroro Great Sky Duel de arimasu! là movie thứ 3 của loạt phim Keroro Gunso sản xuất bởi Sunrise Phim bắt đầu với việc Fuyuki Hinata và Tiểu đội Keroro khám phá Machu Picchu trong Peru. Trong khi khám phá, Keroro đã đụng vào bẫy, và bởi cơ hội đó, cậu ấy tìm ra một tinh thể khổng lồ xanh bên dưới di tích, và có một chìa khóa. Keroro tái máy tay chân Và từ đây câu chuyện bắt đầu
Câu chuyện được bắt đầu với giấc mơ về một thế giới phù thủy của Nôbita. Tuy được Đêkhi giải thích rõ ràng nhưng Nôbita vẫn không nguôi mơ mộng về một thế giới phép thuật. Cùng với đó là sự xuất hiện của hai pho tượng đá Nôbita và Đôrêmon một cách bí ẩn.
Vào một thời điểm nào đó trong tương lai. Trái đất đứng trước thảm hoạ hệ sinh thái bị diệt vong, tổ chức Eternal Eath đã tạo nên một khu rừng nhân tạo để làm nơi bảo tồn thiên nhiên và các loài động vật hoang dã. Nơi đây đc gọi là Rừng Neo. Ở khu rừng đó, một chú sư tử trắng tên Leo, con của chúa sơn lâm Panja, vô tình gặp Kenichi,con của chủ tịch tập đoàn Eternal Eath. Liệu việc con người nhúng tay vào thay đổi tự nhiên là đúng hay sai. Khu rừng nhân tạo Neo có phải là nơi lý tưởng cho muôn
Trong Movie 4 này ta sẽ tiếp tục với Xích Tộc, được gặp gỡ Saruhiko và Misaki thời niên thiếu, hoà chung vào cuộc phiêu lưu của hai người. Hé lộ thêm cuộc sống tẻ nhạt trước khi hai người biết về sự tồn tại của các vị Vương và về bố mẹ của Saruhiko.
Aoyama là 1 cậu học sinh sáng lạng, ham học học và có chút cứng đầu. Cậu ấy rất thích động não, thậm chí đã tính ra số ngày để mình trở thành người lớn. Nhưng hiện tại cậu bé vẫn chỉ là 1 học sinh lớp 4 và điều đó cũng không đến nỗi tệ lắm. Trong một ngày hè cậu đã phát hiện ra bí mật đàn chim cánh cụt xuất hiện trong thị trấn và bí ẩn của chị gái trong phòng khám nha khoa.